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茵陈质量标志物的预测(一)

来源:时间:2025-04-22 02:29:15

基於中藥質量標誌物的茵陈预测理念,對茵陳化學成分有效性、质量生源途徑、标志成分特異性、茵陈预测傳統功效、质量傳統藥性及化學成分可測性進行了潛在質量標誌物的标志預測.通過網絡藥理學進行成分有效性分析,基於文獻整合及數據分析對茵陳的茵陈预测生源途徑、成分特異性、质量傳統功效、标志傳統藥性及化學成分可測性進行質量標誌物預測.結果顯示,茵陈预测網絡藥理學獲得槲皮素、质量異鼠李素及茵陳黃酮等13個活性成分,标志關鍵靶點有AKT1、茵陈预测TNF、质量JUN、标志MAPK1、RELA、TP53及IL6等.GO功能富集分析得到GO條目1 892個,其中生物過程條目1 648個,細胞組成條目82個,分子功能條目162個.KEGG通路富集篩選得到281條信號通路(P<0.05),涉及癌症通路、乙型肝炎及TNF信號通路等.結果表明,結合網絡藥理學和文獻分析得出了茵陳蒿靈A、馬栗樹皮素二甲醚、大牛兒烯D、6,7-二甲氧基香豆素和茵陳色原酮可作為茵陳潛在的質量標誌物。

引言

茵陳為菊科植物濱蒿或茵陳蒿的幹燥地上部分,具有利濕退黃與清熱解毒的功效,主要用於治療黃疸與濕疣等疾病。茵陳的主要成分包括有機酸類、黃酮類、香豆素類及揮發油類等.茵陳的現代藥理作用有解熱、鎮痛、抗炎、抗病毒、抗腫瘤、降血壓、調血脂、抗骨質疏鬆、神經保護、調節代謝及預防阿爾茨海默病等多種功效。中藥質量標誌物(Q-marker)是中藥質量控製的新概念,基於中藥傳遞與溯源、有效、特有、可測和處方配伍的“五原則”,可建立中藥全程質量控製及質量溯源體係,為中藥質量控製提供了新的思路.本文基於Q-marker理論,運用網絡藥理學和文獻分析對茵陳潛在Q-marker進行預測,為整體控製茵陳的質量提供參考依據。

1數據庫和相關軟件

TCMSP數據庫(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),Uniprot數據庫(https://www.uniprot.org/),Gene Cards數據庫(https://www.genecards.org),在線韋恩圖(http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html),DAVID6.8.0數據庫(https://david.ncifcrf.gov/),Omicshare數據庫(http://ww.omicshare.com),STRING數據庫(https://string-db.org/),Graph Pad Prism 6.0軟件及Gytoscape 3.7.2軟件等。

2方法與Q-marker預測

2.1基於網絡藥理學的茵陳成分有效性的Q-marker預測

2.1.1茵陳活性成分及靶點的篩選

運用中藥係統藥理學數據庫和分析平台TC-MSP,以“茵陳”為關鍵詞進行化學成分搜索,以口服生物利用度(OB)≥30%和類藥性(DL)≥0.18為篩選條件,進行茵陳活性成分的篩選,共得到13種活性成分(見表1)。同時,利用TCMSP數據庫收集茵陳活性成分的靶標蛋白。借助Uniprot數據庫,將靶標蛋白名稱導入,物種限定為“Human”,檢索得到的所有靶標蛋白校正Uniprot ID,並得到靶標蛋白所對應的基因名。

2.1.2交集基因的篩選

茵陳的主治疾病為黃疸和濕疹.黃疸臨床常見疾病有急慢性肝炎、肝硬化、膽結石及消化道腫瘤等.以急性肝炎、慢性肝炎、病毒性肝炎、肝硬化、膽結石、消化道腫瘤和濕疹為疾病,利用Gene Cards數據庫查找以上疾病的基因,選擇每種疾病的前300個基因排列在一起,作為藥物的疾病基因,共獲得疾病基因1 050個。利用在線韋恩圖,將成分基因和疾病基因導入,得到交集基因共81個,結果如圖1所示。

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