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茵陈质量标志物的预测(二)

来源:时间:2025-04-22 03:02:32

2.1.3 GO分類富集分析

將所得到的茵陈预测81個靶點導入STRING數據庫進行GO功能富集分析,得到GO條目1 892個,质量其中生物過程條目1 648個,标志細胞組成條目82個,茵陈预测分子功能條目162個,质量分別占73%、标志13%、茵陈预测14%.其中,质量生物過程主要涉及氮化合物代謝過程的标志正調控、大分子代謝過程的茵陈预测正調控、細胞過程的质量正調控、刺激反應的标志調節、細胞對有機物質的茵陈预测反應、細胞對化學刺激的质量反應及對含氧化合物的反應等過程;分子功能主要涉及激活轉錄因子結合、蛋白質結合、标志酶結合及蛋白質異構化活性等功能;細胞組成涉及在膜結合細胞器、細胞質部、胞外區及細胞器等區域.3個分支數量排名前20位相關條目信息柱狀圖如圖2所示.

2.1.4 KEGG通路富集分析

利用DAVID6.8.0數據庫對81個靶點進行通路富集分析,得到281條信號通路(P<0.05),涉及癌症、乙型肝炎和TNF信號通路等,表明這些靶點可能主要通過調控這些通路達到幹預疾病的目的.前20位信號通路氣泡圖如圖3所示.

2.1.5“成分—靶點—通路”網絡構建及分析

將富集分析得到的排名前20的通路所對應的57個作用靶點及13種成分,運用Cytoscape3.7.1軟件構建“成分—靶點—通路”網絡,根據網絡的拓撲學性質度值排序確定關鍵節點,在所構建的網絡中,依據Degree值(度值)確定關鍵節點,度值>中位數(成分度值中位數=3,靶點度值中位數=15,通路度值中位數=14)的成分有4種,靶點有28個,通路有10條.4種成分為槲皮素、異鼠李素、β-穀甾醇及茵陳蒿靈A,度值分別為55、8、7和5,由於該4種化合物在網絡中具有較高的連接度,提示這可能是茵陳發揮藥效的主要活性成分.靶點的關鍵節點分別是AKT1、TNF、JUN、MAPK1、RELA、TP53及IL6,度值分別是38、37、37、36、36、34及31,表明這可能是茵陳化合物作用於癌症、腫瘤、乙肝與病毒等信號通路潛在的關鍵作用靶點.網絡藥理學研究從成分有效性角度提示槲皮素、異鼠李素、β-穀甾醇及茵陳蒿靈A等成分可作為茵陳潛在Q-marker進行深層次研究.

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