2、比较單核苷酸多態性和小片段插入與缺失的基因分析

與參考基因組相比，Yarrowia lipolytica BBE-17共有43921個單核苷酸多態性（SNP）變化（圖3），组分其中42577個是比较純合SNP，1344個是基因雜合SNP，27515個是组分轉換的SNP，16406個是比较顛換的SNP，有7871個是基因同義突變，3711個是组分非同義突變；位於基因間區的SNP突變有32339個，每1000bp序列平均有2.4個單核苷酸多態性變化。比较整個基因組有8078個小片段插與缺失變化（InDel），基因其中插入的组分片段是3924個，缺失的比较片段是4154個，有7740個是基因純合變化，有338個是组分雜合變化。有4256個基因發生了單核苷酸多態性變化，但是沒有基因發生小片段插入或缺失的變化。

3、基因組結構變異分析

基因組結構變異（SV）指基因組水平上大片段的插入，缺失、倒置、易位等序列。與參考基因組比對發現，有129個大片段的基因組結構變異（圖4）。其中缺失片段106個，倒置片段2個，染色體內部遷移7個，染色體間的遷移14個，有44個發生在基因間區，64個結構變異發生在基因中。份BBE-17結構變異所涉及的基因有109個，全部為缺失型變化（表1）。

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